上海市东方医院南院医学检验科是上海市公共卫生重点学科、浦东新区医学检验重点学科，是集临床化学与免疫学、临床微生物学、分子诊断、临床血液体液及输血专业于一体、获CNAS（ISO15189）认可的大型标准化医学实验室、浦东新区区域性医联体实验诊断中心。南院检验科是同济大学临床检验诊断学的硕、博士研究生培养点，博士后流动站。主办多次市级继续教育项目，参会学员超万人次。每年招收进修医技1-3名，实习生10-15名。近年来，培养研究生10余名。科室配备RocheInfinity标本前处理流水线、RocheCobas702全自动生化分析仪、E801免疫分析仪、Rochet711全自动凝血流水线、Roche尿干化学分析仪以及尿有形成分分析仪、全自动血液分析流水线、ThermoFisher自动微生物检测系统、SensititreTM全自动药敏系统和实时荧光PCR仪、高通量基因测序仪等，已建成符合国家标准的加强型生物安全II级病原微生物实验室以及基因扩增实验室。全面开展各亚专业检验业务，为医疗服务和公共卫生安全提供疾病诊断、治疗、预后或评估人体健康的客观检验数据，同时提供医疗咨询和临床科研服务等。医学检验科实施全流程质量控制，着力打造优质、高效的临床服务。在临床微生物学和分子诊断领域特色显著，是上海市细菌真菌耐药监测网真菌工作组单位和华东地区侵袭性真菌感染工作组牵头单位，在病原微生物感染、疑难病实验室诊断、耐药菌分子流行病学和耐药机制研究方面居先进水平。科室拥有博士研究生导师2名，硕士研究生导师4名，讲师8名，中高级职称占62%，硕士以上人员占50%，5名优秀青年入选市、区及院级各类人才培养计划。科主任吴文娟是上海市优秀技术带头人、卫生系统优秀学科带头人和全国卫生健康系统新冠肺炎疫情防控工作先进个人。科室承担国家科技重大专项、上海市公共卫生重点学科、国家自然科学基金等纵向课题30余项，发表SCI和核心期刊论文120余篇、主编专著4部，申请专利10余项。团队荣获上海市浦东新区科技进步奖二等奖、上海市卫生健康系统先进集体和进博会最美服务窗口等荣誉。秉承“爱在东方”的医院文化，坚持“优质服务、质量为本、管理科学、持续改进”的质量方针，弘扬“感恩、包容、坚持、诚信”的科室文化，医学检验科竭诚为临床和患者服务，全力打造一流科室。