衡阳市妇幼保健院儿童保健科是全市儿童保健技术指导中心，是最具保健特色专科，是一支拥有主任医师1名、副主任医师4名的强劲的专家队伍，能开展O-18岁儿童健康体检。相继成立生长发育专科、新生儿疾病门诊、儿童心理门诊。儿童保健科主要开展儿童保健体检、体格发育评估、脑发育评估、生长发育监测、智力测验、营养指导、早期指导、肥胖及厌食症的治疗、性早熟的诊断及指导、矮小症的诊断和治疗、未来身高预测、骨龄测定，气质、行为评定，多动症的诊断和治疗、骨质超声分析仪、微量元素缺乏症的诊断和治疗、甲状腺功能减低的病人诊断和治疗、苯丙酮尿症的随访、佝偻病早期预防治疗、自闭症的早期诊断。耳鼻喉科门诊：为衡阳市0-6岁儿童听力检测中心，省卫生厅认证的衡阳地区唯一的儿童听力检测机构，同时可开展儿童常见耳鼻喉科疾病诊治，擅长儿童鼻炎、中耳炎、扁桃体炎、腺样体肥大、鼻腔及外耳道异物等疾病的治疗。儿童口腔按保健：开展龋病的预防和治疗、牙髓和根尖周病的诊断和治疗、舌系带矫正、反殆矫正、牙列不齐矫正、口腔颌面部小肿物切除术等。在儿童口腔保健方面独具特色。眼保健科：市内首家引进"美国Retcam-3"暨"儿童眼底广域照相机"设备，能开展早产儿及足月儿的眼病早期筛查工作，并能开展婴幼儿常见眼病的诊治及青少年常见眼病、屈光不正、弱视的诊断与治疗，成立湘南地区的儿童眼保健中心。儿童保健科承担全市20家优秀直管幼儿园的入园入托体验，卫生保健指导工作，承担全市13个县市区的儿童保健技术指导。