药学部是集药品供应保障、临床药学、制剂配制、药学教学和科研为一体的综合技术职能部门。下设药品药剂科和临床药学科，药剂科包括门诊西药房、门诊中药房、住院药房、药库和制剂室。药学部现有人员44人，其中药学专业人员42人，包括高级职称11人，主管药师16名，博士4人，硕士12人。近年来，药学部致力于医院药学的规范化建设，建立、完善并落实药事管理的各项制度和操作规程，积极推进安全合理用药工作，着力打造和谐科室文化，参与教学和科研工作。成立药事质量管理小组；开设药物咨询窗口；每月进行处方点评并公示；建立临床药师制；定期组织全科业务学习；每年带教数十名实习生。药学部秉承以病人为中心的服务理念，竭诚为广大患者和医务人员提供优质药学服务，并取得了一些成绩。近年来主持立项课题10余项，其中国科金1项，省部级科研项目7项，厅局级以上科研项目5项；发表学术论文50余篇，其中SCI收录论文10余篇；参编英文专著1部。已获国家药物临床试验机构资质。部分药师荣获"2018年陕西省医药经济信息网信息工作先进个人"、"2019年全国医药经济信息网信息工作先进个人"、"2019西安药学会优秀药师"、"2020西安药学会优秀药师"等称号，药学部党支部荣获"2021年西安市卫健委先进基层党组织"。