神经外科由国内著名神经外科先驱蔡宝贤教授始创于上世纪60年代历经陈道8A神经内科莅教授、朱晓江教授,以及现任主任楼美清教授四代传承和发展,已成为集医疗、教学、神经外科科研于一体的现代化研究型学科。现为上海交通大学博士学位授予点。神经外科分南、北两部,开放床位近100张,重症监护床位22张,配备有高端显微镜(3台)、神经内镜系统(2套)、神经导航系统(红外导航、电磁导航),以及超声刀超声吸引(2台)、神经电生理监护系统等国际一流的现代化手术设备。以神经肿瘤、脑血管病以及脊髓脊柱神经外科、颅脑创伤为诊疗特色。神经外科与国际神经外科接轨,形成以显微镜、内镜、导航、介入及分子诊断等新技术相结合的研究型微创神经外科特色。科室的特色诊疗疾病有导航辅助内镜下垂体瘤微创手术、胶质瘤的个体化诊疗、听神经瘤微创手术、脑膜瘤的微创治疗;脊柱内镜下脊柱退行性疾病(腰腿痛、颈肩痛),枕颈部畸形(chiari"s畸形)椎管肿瘤、脊髓脊柱神经外科疾病等微创治疗;动脉瘤的夹闭或介入治疗、难治性动脉瘤颅内外搭桥手术,血管畸形的手术+介入治疗,烟雾病的颅内外融通术,颈内动脉内膜剥脱和支架植入术神经外科团队主攻的疾病因技术难度高、效果好代表学科前沿微创技术,已先后三次在央视十套《科技之光》栏目播出,受到广泛好评目前学科荣获上海市科技成果奖二等奖2项,承担包括国家自然科学基金项目、上海市科委基金项目在内的科研项目10余项,发表SCl论文30余篇。神经外科注重学科团队建设和人才培养,与美国、德国有良好的协作关系。神经外科负责人包括:科室主任楼美清,副主任(北部)薛亚军,执行主任(南部)刘耀华。