胃肠外科拥有一支专业技术过硬、结构合理的医疗团队，现有8名医师，均有硕博士学位,高级职称4人。以中西医结合、腹腔镜消化道肿瘤微创手术、快速康复为主要医疗特色。目前正式床位30张，拥有腹腔镜、胃肠镜、电外科工作站、超声刀、腹腔热灌注化疗机等各类先进仪器设备。年出院病人近3000人次，年手术2000台以上，3、4级大手术占2/3。周一至周五全天设有专科门诊，周三、四下午设立专家门诊。作为上海中医药大学的附属医院，胃肠外科同时肩负着医科教育的任务，承担了大量西医外科的教学工作，包括上海中医药大学五年制、七年制的理论授课及临床见习、实习带教工作，研究生培养，以及基地规培医师的临床带教工作。多次被评为"最受欢迎教研室"。在科研方面，胃肠外科积极探索消化道肿瘤的中西医结合临床与基础研究，在研和已完成局级以上课题多项，在核心期刊上已发表论文20余篇。