临床功能检查科下设内镜中心及心电图、脑电图等功能检查区。内镜中心常规开展胃肠镜检查，尤其重点进行胃肠道早癌的筛查和内镜下微创治疗如内镜下粘膜切除术（EMR）、内镜下粘膜剥离术（ESD）、经口内镜下食管下段扩约肌切开术（POEM）等，均取得了良好疗效及口碑。已经引进超声内镜，开展超声内镜下早癌及肿瘤起源及浸润深度探查、经超声内镜下肿瘤穿刺活检等诊治项目。内镜下粘膜剥离术（ESD）是我科核心技术，其技术原理就是通过对消化道病变处粘膜下注射，使粘膜下层的厚度和空间扩展，以便于切除粘膜层的病变。它对组织损伤小，不影响脏器功能，术后恢复快，住院花费少，已成为内镜下最重要的治疗手段之一。在其基础上发展起来的新型治疗手段也越来越多，适应证也越来越宽，是消化内科未来的发展方向。功能检查专区开展心电图、心脏电生理、肌电图、脑电图检查、诱发电位、经颅多普勒（TCD）碳13和碳14呼气试验检查和肺功能检查、呼吸功能检查等。除了日常门诊及住院病人检查外，还承接了大量的单位体检工作，各功能分区明确，工作有条不紊，日臻完善。