眼科是集医、教、研为一体特色鲜明、疗效显著的科室之一。拥有先进的手术设备和检查设备，如白内障超声乳化仪、玻璃体切割机、高清手术显微镜、视野检查仪、血流光学相干断层扫描（OCTA）、荧光血管造影仪、免散瞳眼底相机、眼前段照相机、眼底激光机、YAG和SLT眼前段激光机、医学综合验光仪、视觉电生理检查仪、IOLMaster光学生物测量仪、角膜曲率仪、非接触式眼压计、眼科AB超等。能熟练开展白内障超声乳化手术、各类青光眼手术、复杂性视网膜脱离手术、斜视手术、去眼袋、重睑（双眼皮）等各类手术。广泛开展中医特色诊疗项目，灵活应用中药方剂、离子导入、超声雾化、穴位注射、针灸疗法、中成药治疗青盲、暴盲等，充分发挥中医药防治眼病的优势，取得良好的疗效。眼科现有主任医师1名，副主任医师2名，主治医师4名，硕士研究生导师1名，具有硕士学位者3名。眼科非常注重医疗质量的管理工作，是首届全国中医眼科医联体常务理事单位，也是上海市眼科临床质量控制联盟委员单位之一，承担虹口区视力残疾鉴定工作及虹口区糖尿病视网膜病变筛查指导工作。科室采用现代化教学手段，如影像同步示教、手术观摩等方法带教医学院本科生、规培生多年，是上海中医药大学全科医师规培基地。已带教硕士研究生7名，其中外籍研究生1名。是全国中医药行业高等教育"十四五"规划中西医结合眼科教材编写委员单位之一。眼科特别注重糖尿病视网膜病变的临床和基础研究，在该领域已发表科研论文30余篇，其中SCI收录3篇。近年来顺利完成数项市级、区级科研项目，协助完成国家科技部重大专项1项和国家863计划基金资助项目1项。