神经外科自1993年成立以来，至今已经20余年，经过不断发展壮大，成为一个集颅脑创伤创伤、脑血管病介入和手术治疗、神经肿瘤、r-刀治疗中心、神经康复治疗、脊柱脊髓病等多个亚专科的神经系统疾病治疗中心，尤其是对颅内巨大动脉瘤、颅底肿瘤、复杂垂体瘤、听神经瘤、巨大动静脉畸形等各种神经外科疑难病种的诊断和治疗在省内外居于领先水平。神经外科于1998年被评为"云南省临床重点科室"，2003年成立云"南省亚低温治疗中心"，是卫生部"十一五"及"十二五"科技攻关项目协作单位，承担及完成国家自然科学基金项目6项，教育部博士点基金项目1项，省级科研项目20余项。现有"云南省学术与技术带头人"2人，培养博、硕士研究生50余人。