结构性心脏病是一类因心脏结构改变引起心脏病理生理变化的心脏大血管疾病的统称，如先天性心脏病、心脏瓣膜疾病、心脏大血管狭窄或者阻塞、心肌病等。在过去十年中，结构性心脏病的诊断及治疗取得了飞速发展，引领着介入心脏病学的发展。云南省阜外心血管病医院在总院长胡盛寿院士的倡导和支持下，在省内率先创建了结构性心脏病中心，融合了心血管内科、外科、放射科的专业人员和技术优势，在经导管先天性心脏病介入治疗、经导管瓣膜置换术、复杂冠心病介入治疗等方面居国内甚至国际领先地位。科室培养博士、硕士研究生多名，接收全国广大基层医院临床专科医师的培训。目前承担多项国家自然科学基金及省部级科研基金研究，不仅拥有响誉全国的老专家，还有掌握高精尖技术，年轻有为的的博士和硕士青年专家。主要特色医疗：各种先心病介入治疗、瓣膜病介入治疗（微创瓣膜置换、成型）；左心耳封堵；冠心病介入治疗。各种诊疗技术国内领先，其中先心病介入治疗居世界先进水平，辐射周边各省及东南亚国家的先心病救治。