心胸外科于1995年成立并独立开展体外循环心脏直视手术及普胸手术，为省内******的儿童心胸外科专科，经过19年的发展，已完成心脏手术2000例，普胸手术3000例，科室医护人员均到上海儿童医学中心及浙江大学附属儿童医院进修心胸外科，与国内多家技术先进的儿童心胸疾病诊疗中心有密切的技术交流，科室拥有高、中、初级医护人员，有各级学科带头人，结构合理，业务发展良好，有配套完善的监护病房，心脏手术最小年龄为出生后19天，体重1千克，在小年龄、低体重、复杂先心病的治疗方面处于省内领先水平，达到了国内先进水平。科室在省内率先开展了先天性食道闭锁及漏斗胸的微创手术治疗，取得了较好的社会效益。科室是省市新农合及医保儿童心胸疾病的定点收治单位。2002年成为昆明市医学重点学科；2005年成为昆明市心血管病中心儿童医院分中心。心胸外科主持的科研课题"婴幼儿腹腔镜的临床应用研究"获2006年度昆明市科技进步奖；"微创手术治疗小儿漏斗胸的临床应用研究"获2010年度云南省卫生科技成果奖；2009年度西山区科技进步奖。科室医护人员在各级医学期刊发表论文90多篇。医护人员受聘担任多个专科学会的常委、委员。科室取得的荣誉：主持的科研课题"婴幼儿腹腔镜的临床应用研究"获2006年度昆明市科技进步奖；"微创手术治疗小儿漏斗胸的临床应用研究"获2010年度云南省卫生科技成果奖；2009年度西山区科技进步奖。科室医护人员在各级医学期刊发表论文90多篇。分获2011年度和2012年度儿童医院业绩突出奖。科室的特色技术：在儿童心胸疾病的手术治疗方面处于省内领先水平，尤其是在小年龄、低体重、复杂先心病的手术治疗及先天性食道闭锁及漏斗胸的微创手术治疗方面达到了国内先进水平。