吉林大学中日联谊医院泌尿外科的前身是白求恩医科大学泌尿外科，创立于1949年，是我国一流的泌尿外科学临床和研究中心，我国许多外科学界泌尿外科专业的老前辈，如肖连升教授、牛芳儒教授、邢广军教授、王梦文教授、孔祥波教授等都曾在这里执教和工作过。在前任主任、我国著名泌尿外科学家、中华医学会泌尿外科分会前任主任委员孔祥波的带领下,泌尿外科获得了教育部重点学科，卫生部重点专科等一个又一个殊荣。现任主任是中华医学会泌尿外科分会主任委员谷欣权教授。科室内拥有教授6名，副教授5名，主治医师12名，住院医师3名，博士26人，建有泌尿外科研究中心，专研究人员2人。泌尿外科现共有3个病区128张病床，设置有普通病房和特需病房，以满足不同层次的医疗需求；泌尿外科坚持"科有特点，人有专长"的发展规划，在省内率先培养并建立结石、肿瘤、男科、尿控、小儿专业组；患者可根据不同的需要选择泌尿外科专家门诊、泌尿外科普通门诊的服务，而泌尿外科急诊则全年365天、全天24小时对患者开放，随时为患者提供医疗服务。自1989年开始，泌尿外科率先在国内开展腹腔镜下前列腺癌根治术、膀胱全切术、肾盂成形术等难度较高的术式，并均可独立完成，先后引进、改良并推广了小通道经皮肾镜碎石取石术，荧光原位杂交诊断早期泌尿系肿瘤、经皮肾镜球囊扩张术、显微镜下精索静脉高位结扎术，输尿管软镜治疗上尿路结石，口腔黏膜移植尿道成形术等国际先进技术和设备治疗各类相关疾病，取得了良好的效果。目前泌尿外科是一个以肿瘤、结石为重点，微创为特色等在东北三省乃至全国的领先地位。泌尿外科注重年轻骨干力量的培养，不仅让他们学习、继承老专家的优良品质和工作作风，还先后安排多位年轻医生去美国、日本等国家和地区进修、深造，目前都已学成归国，成为科室的骨干。泌尿外科同时还注重与国内外著名院校和专家进行交流，曾先后邀请美国、日本等国家的泌尿外科专家来院进行手术演示、作学术报告、研讨问题，以提高泌尿外科的诊治和科研水平；注重科研和医疗的结合，先后申请并承担了吉林省科委、国家自然基金重点、面上项目及国家863课题首席科学家等科研项目，累计科研经费超过600余万元人民币。