1987年，医院成立角膜病科。是山西省首批重点学科，也是全省唯一的角膜病专业学组。目前，角膜病科设病床30张，医生6人，护士19人，与眼眶眼肿瘤科共用一个护理单元。其中主任医师3人，主治医师3人；博士后1人，博士生1人，在读博士生1人，硕士研究生3人。山西医科大学兼职教授3人。科主任为杨纪忠，副主任为王效武，副护士长为李宏（主持工作）。科室开展的主要技术项目：各种类型板层角膜移植术（特别是难度较大的边缘性板层角膜移植术和指环状板层角膜移植术）、穿透性角膜移植术、自转性穿透角膜移植术、自体穿透角膜移植术、眼前节再造术、角膜白斑染色术、角膜肿瘤切除术、角膜内屏障重建术、自体结膜移植术、羊膜移植技术治疗眼表疾病（包括各种眼表烧伤、角膜溃疡、翼状胬肉、大泡性角膜病变、睑球粘连，持续性角膜上皮缺损等）、深板层角膜移植术、异体角膜缘干细胞移植联合穿透性角膜移植术治疗血管性角膜瘢痕、角膜交联术治疗圆锥角膜13余项。1985年，建立了山西省眼科医院眼库（山西省红十字眼库）。为开展角膜移植手术及时、可靠地提供角膜材料来源，从而提高角膜移植手术的成功率。近年来，科室先后科研立项共20项。其中国家自然基金2项；山西省自然科学基金3项；山西省科技攻关项目6项；山西省回国留学人员科研项目3项；山西省引进人才择优资助项目1项；山西省人社厅留学人员择优资助项目2项；山西省卫生攻关项目3项。其中18项已结题，2项正在进行中。先后荣获山西省医药卫生技术引进技术奖2项，山西省科技进步二等奖4项、三等奖3项，获太原市"十佳"科技成果奖2项。先后在中华、国家级杂志发表专业论文100余篇，其中SCI收录12篇。