上海市公共卫生临床中心眼耳鼻喉科包括眼科及耳鼻喉科二个专业，是在本中心"大专科、小综合"指导思想下建设的学科，秉持"仁德、奉献、卓越、创新"的理念为广大眼病、耳鼻喉科疾病患者提供优质医疗服务。本科室是以各专业常见病、多发病的诊治为基础，以感染性相关眼病、耳鼻喉科疾病的临床诊治和研究为特色的学科。?本科室眼科诊疗范围为眼睑疾病、结膜疾病、角膜疾病、晶状体疾病、葡萄膜疾病、玻璃体疾病、视网膜疾病、视网膜血管疾病、眼眶疾病，神经眼科疾病等。开展白内障超声乳化术、人工晶体植入术、玻璃体切割术、视网膜脱离复位术、视网膜激光光凝术、YAG激光治疗眼前段疾病等技术。耳鼻喉科诊疗范围为鼻部疾病、鼻窦疾病、咽喉部疾病、耳部疾病。开展耳鼻喉肿瘤切除术等技术及中医药治疗耳鼻喉科疾病。本科室的特色是对感染性眼病、感染性耳鼻喉科疾病的临床诊治，如巨细胞病毒视网膜炎、眼部卡波西肉瘤、眼部淋巴瘤、HIV视网膜病变、结核性葡萄膜炎、梅毒性葡萄膜炎、视网膜血管炎、病毒性角膜炎、喉结核等。在科研方面，开展了巨细胞病毒病原学检测2项：聚合酶链反应（PCR）检测和PP65抗原检测；进行了艾滋病相关疾病的课题研究，如《巨细胞病毒视网膜病原学诊断方法的建立》、《HIV视网膜病变微循环改变研究》、《免疫抑制大鼠巨细胞病毒视网膜炎动物模型的建立》等；参加了国家十一五重大科技攻关项目专项课题《艾滋病合并TB的抗结核治疗研究》的子课题《艾滋病合并眼病的流行病学调查》的研究（2008ZX10001-008），参与美国NIH项目合作，CentralauditoryprocessinginHIV-positiveindividuals（1R01DC014369-01）。发表中文核心期刊论文13篇，SCI1篇。参加了《艾滋病防治学》、《结核外科》、《艾滋病图谱》、《特殊感染外科新理念与新技术》、《眼科疾病临床诊疗精要》4部专著相关专业章节的编写工作。眼科配备有HAAG-STREIT裂隙灯、TOPCON眼底照相/荧光造影机、眼前段数码照相裂隙灯、CANON非接触眼压仪、TOPCON非接触眼压仪、CANON电脑验光/角膜曲率仪、电脑视野检测仪、眼科电生理检测仪、IOLMASTER光学测量仪、光学相干断层扫描仪及眼底镜等眼科常规检查设备。有玻璃体超乳一体机、眼科冷冻治疗仪、532眼底激光治疗仪、YAG激光治疗仪等治疗设备。耳鼻喉科配备有硬质纤维内镜检查摄像系统、耳鼻喉科综合治疗台及其他常规检查设备。