儿童口腔科成立于2009年，是集临床医疗、教学、科研于一体的儿童口腔医学专业科室。现有医护人员40余人，其中副主任医师2名，主治医师15名；硕士生导师1名。儿童口腔科现有口腔综合治疗椅52台，诊疗内容全方位涵盖本学科所涉及的所有范围，所用的诊疗标准和技术手段保持与国内、国际先进水平同步。目前在儿童龋病、乳牙及年轻恒牙牙髓根尖病、牙外伤诊治和儿童咬合诱导等方向处于省内领先水平。承担浙江大学儿童口腔医学本科教学任务，国家级和省级儿童口腔病学的医学继续教育，住院医师规范化培训工作与进修工作等。儿童口腔科是中华口腔医学会儿童口腔专业委员会常委、青年委员单位，浙江省口腔医学会儿童口腔医学专委会副主任委员单位。主持多项国家自然科学基金项目、省部级及厅级项目。儿童口腔科注重加强与国内外院校的合作与交流，积极参加国内国际学术交流与合作，如聘请美国罗马琳达大学牙学院儿童牙科系主任陈容维教授为兼任教授。