内镜中心内设有电子胃镜室、肠镜室、十二指肠镜室、超声内镜室、双气囊小肠镜和胶囊内镜室、支气管镜室、电子喉镜及鼻内窥镜室、胆道镜室、膀胱镜及输尿管镜室和宫腔镜室等，是目前省内整体规模较大的内镜中心之一内镜中心引进了先进的一体化内镜清洗中心，使内镜经过初清洗、酶洗、浸泡消毒、末清洗等技术流程，达到彻底清洗的良好效果，为预防院内感染提供了更加可靠而安全的保证。内镜中心目前可以开展各种内镜检查和治疗，特别是无痛的胃、肠镜的检查，双气囊小肠镜和胶囊内镜检查，输尿管镜检查及治疗，支气管镜的检查及治疗；其中十二指肠镜治疗胆胰疾病和黏膜下剥离术(ESD)治疗达到省内领先地位。