输血科是医院重要的医学诊断部门，直接指导临床输血的终端操作。2000年6月医院成立输血科时隶属于检验科，2010年8月从检验科分离，独立建科，经过20多年发展，目前是台州市医、教一体化发展的输血规范化基地。面积300多平米，年常规用血量6000单位。现有专业技术人员7名，其中高级职称2名，中级积称4名，初级职称1名，人才梯队较为合理。科室开展的主要业务有：临床用血管理、临床供血（全血、血液成份和血液制品）、自体输血、输血相容性检测、新生儿溶血病检测、血型和疑难血型鉴定、不规则抗体筛查和鉴定试验等。其中对一些有特殊抗体的患者，有较完善的检测和输注模式，取得了较好的临床效果。学科承担市级课题项目3项、院级课题3项，发表一二级以上相关论文20余篇，获得发明专利2项。承担台州学院大学本科教学工作任务。2019年12月输血科成为浙江省市级医疗机构输血科（血库）从业人员岗位规范化培训基地，目前共拥有培训师资4人，2020年已有1名顺利通过输血医师规范化培训并顺利通过结业考核；通过制度的建立、不断的意识加强、创新技术的推进，近10年来，在出院人次已经翻倍增长，手术量持续攀升情况下，用血量持续控制良好。自开展自体输血以来，全院自体输血率从独立建科之前的几乎为零到目前30%左右，外科系统更是高达50%左右，手术自体输血率高达75%。参与临床大量输血及疑难输血病例讨论和会诊，充分保障临床输血安全。２０１５年获得台州市无偿献血先进工作单位称号。