学院办公室是医院临床教学管理的职能部门，其工作职能主要有三个方面，即管理职能、行政职能和服务职能。管理职能1.认真贯彻党的教育方针，完成温州医学院下达的各项教学任务和其他教学工作；2.协助院长管理各教研室、科室做好医院临床教学工作；3.学生政治思想、学习、工作、生活的管理。行政职能1.制订教学计划，督促检查各教研室、临床科室圆满完成；2.制订各种教学管理制度；3.深入各科室了解和掌握学生的学习与工作情况；4.及时向学生介绍医院及有关科室的情况，规章制度和各种注意事项；5.负责对学生的教育、管理、考核、奖罚等工作；6.解决学生住宿，膳食及其他生活问题；7.协助温州医学院做好研究生班的管理工作；8.参加医院的例会并传达会议精神；9.完成医院党委、行政交办的其他工作；10.保持工作区域内的清洁，各类物品、资料存放整齐有序。服务职能1.及时将教学计划发送到相关教研室和科室；2.对每位授课老师通知3次（课表发放时、课前1周、课前各1次）根据授课老师要求，增减通知次数，并电话或短信告之，做到无遗漏，无差错；3.及时发放教学津贴；4.及时发现并解决学生的思想问题、生活困难；5.以医院服务理念为宗旨，热情对待所有的来访者；6.虚心接受与教学工作相关的各科室和部门的建议和反馈，并及时改进，不断完善工作；7.与医院各相关科室保持良好的合作关系；与各主管部门、温州医学院各相关部门、附属医院、教学医院相关部门保持良好的合作关系。