西药房成立于上世纪50年代，是集药品供应和管理、临床药学及监督执行药政法律法规为一体的综合性技术部门。下设门诊西药房、病区药房、急诊药房、临床药学室等4个部门。有一支科研、教学能力较强的专业队伍。现有药学专业技术人员26名，其中正主任药师2名，主管药师7名，药师17名，其中硕士研究生1名。55岁以下中青年药师已全部达到大专以上学历。负责组织实施包括西药的调剂、药品供应及药品质量控制、不良反应监测等药事管理工作，建立建全各项规章制度和技术操作规程，积极推行规范化、法制化、目标化、现代化管理模式。门诊开放式发药窗，与病人零距离接触，药房设有专人负责的用药咨询窗，定期更新《用药信息》栏目内容,为患者和临床提供药物信息和合理用药指导。医院已建立起静脉药物配制中心，负责全胃肠外静脉药物。担负培养药学专业本科生和大、中专生的教学实习进修任务和科研工作，参与药品不良反应的收集上报，药师下病房配合临床医生加强合理用药工作的开展，药物利用评价与分析及计算机应用等领域的研究工作，以使管理的效果优质、高效、低耗，以确保病人用药的经济、安全、有效。及时向医务人员介绍药学领域的新知识、新成果、新技术、新方法、迅速反映医院药品使用及管理情况。本世纪初首批被浙江省卫生厅被授予"放心药房"的称号，多次被评为市药剂质控中心优秀单位，历次省等级医院检查均成绩优异。2013年获"省药剂质控中心医院处方管理优秀奖"，近年来在省级以上杂志发表科研论文30余篇，完成科研课题1项，未结题课题1项，其中3篇论文获嘉兴市自然科学优秀论文一、三等奖，本科药师多次被评为省级先进，多次获得市级案例及健康演讲竞赛二等奖。2013年青年药师继取得市健康演讲比赛第一名后又代表嘉兴获得省竞赛二等奖，实现了本地区零的突破。本科室在医院组织的各项竞赛中也均名列前茅。中药房成立于20世纪50年代，现有专业技术人员24名，其中高级职称1人，中级职称4人，初级职称19人。科室设置有中药饮片调剂室、中药库房、中药煎药室等，其中调剂室面积达150平方米，煎药设备包括煎药机20多台及制作膏方所需的蒸汽夹层锅等设备。中药房在中药调剂、中药用药宣教、中药合理应用、中药代煎、膏方制作等方面具有完备的力量。煎药房成立于1999年，经过十余年的技术沉淀经验积累已经发展成为嘉兴五县两区颇具规模及实力的煎药房，配备有先进的东华原YJD20--GL十功能循环煎药机及东华原YB50—250E中药均分包装机30余台，采用多级过滤.循环煎药的方式促使药材有效成分快速析出，并同时配备全自动挤压装置，保证药液至真至纯。