嘉兴市第二医院耳鼻咽喉科创建于1931年，已有近90年的历史，是嘉兴市技术、规模、设备先进的特色专科，是嘉兴医学会耳鼻咽喉-头颈外科分会主委单位，为嘉兴市医学重点学科，国家级耳鼻咽喉科住院医师规范化培训基地。具有中、高级职称医师十余名，技术骨干均在上海、北京、杭州等医院进修、学习，在嘉兴市及周边地区一直享有较高的声誉。2019年5月，与复旦大学附属眼耳鼻咽喉科医院签署了合作协议，并成立了耳鼻咽喉科联合诊疗中心，借助复旦大学附属眼耳鼻喉科医院的优质资源，耳鼻咽喉科得到了快速发展。拥有纯音测听、脑干听觉诱发电位、多频稳态、声导抗、耳声发射、电子喉镜、高速耳钻、鼻颅底切割系统、二氧化碳激光、喉动态镜、嗓音分析仪、高清显微镜、全高清内镜系统等高档设备，已广泛开展了鼻内镜手术、小儿腺样体手术，喉显微手术、耳显微手术、耳内镜手术、全喉切除手术、喉部分切除喉功能重建，鼾症手术、喉激光手术等，近年在嘉兴市率先开展了二氧化碳激光声门上型喉癌切除术，下咽癌全下咽、全喉、食管上端切除、游离皮瓣修复术，耳内镜人工听骨植入、鼓室成形术，人工耳蜗植入术，鼻内镜下鼻腔鼻窦恶性肿瘤切除术、鼻颅底肿瘤切除术、复发性鼻咽癌切除术，鼻内镜下高选择翼管神经切断术治疗变应性鼻炎、鼻咽癌放射性颅骨坏死鼻内镜下手术等高难度手术，很多技术在省内领先。