病理科是绍兴市第四批医学重点学科，绍兴市围产儿死亡病理解剖指定单位，妇产科病理学领域的学术水平位于全省前列。科室设有病理诊断室、常规病理实验室、免疫组化及分子病理实验室、PCR实验室、细胞病理学实验室、标本及资料档案室等。开展项目包括常规病理诊断、术中冰冻快速病理诊断、穿刺细胞学、液基细胞学、DNA细胞陪体定量分析、远程病理会诊。科室运用先进的分子病理学技术对妇科肿瘤的组织类型、细胞分化以及对放、化疗治疗的敏感性和预后状态进行分析和判断，为临床治疗和病人预后提供了详实可靠的依据。