中医科自1951年"福康医院"时代开设中医门诊到现在已经走过了整整60多年。历史上著名的"绍派伤寒"传人、名医傅再杨系科室创始人。科室从1978年开设中医病房以来到目前的有床位41张，年出院病人数达1300多人次集科研、教学、临床于一体的中西医结合病房，是绍兴地区规模最大、技术力量最雄厚的、综合实力最强的中医内科诊治中心；又是浙江省中医住院医师规范化培训"中医内科"基地，同时"中医肝胆"为绍兴市第三批医学重点学科，2015年4月被国家卫计委、中医药管理局评为全国综合医院示范中医单位。目前科室有医护人员24名，其中主任中医师3名，副主任中医师3名。中医门诊：开设有中西医结合肝胆、胃肠、肿瘤、呼吸、老年病等专家专科门诊和中医内科普通门诊。分别有国家级、省级、县级名中医及高年资的中医师坐诊，辐射面达整个绍兴市、上虞市、新昌县、慈溪、萧山等周边城市。中医病房：开设病床41张，科内配有一整套的高素质、高水准的医护治疗团队，借助现代医学的诊疗技术及CT、MRI、放射、免疫、生化等先进的仪器明确疾病，再用中医的辨证论治处方用药，"衷中参西"是本病房的一大特色，所收治的病种几乎包括了肝胆、呼吸、消化、神经、心脑血管、肿瘤等所有内科方面的的疾病。近几年来，科内平均每年收治病例达1300例左右，年抢救危重病人30余例左右。中医肝胆：是第三批市医学重点学科，拥有医护人员20名。设专科门诊，科内每周一到六上午都有专家出门诊。学科自创建以来，科内人员运用中医、中西医结合治疗肝胆病，取得了多项科研成果，其中中药配合脐疗、隔姜炙、穴位封闭法、耳穴贴压、推按运经仪等中西医结合治疗胆道结石及胆道术后或ERCP术后残余结石，提高排出率和排净率，开展肝穿刺技术等措施对肝硬化进行早期诊断、早期治疗，用软肝消积饮治疗脂肪肝，PTCD肝内外胆管引流术治阻塞性黄疸等新技术新业务在市区具有一定的影响。科内重点研究疾病为肝硬化腹水(鼓胀病)、慢性病毒性肝炎(肝着)、脂肪肝、酒精性肝病(肝癖)。中医科在抓好业务建设的同时，科研工作也取得了很大成绩。2项课题获浙江省中医药科技成果三等奖，4项科研成果分别获得省、市科技进步奖。近2年来又有2项科研项目通过市科技局的评审，获得国内领先的赞誉。近20年来，全科发表于国家及省级以上学术刊物相关学术论文达200余篇。