绍兴市上虞妇幼保健院中医科于2016年初独立建科，开始设有中医内科、中医妇科、中医骨伤、推拿科、针灸科，之后又陆续增设中医儿科、中医皮肤科、刺血、中医护理门诊、中医治未病专科门诊。2020年4月初中医科从门诊大楼3楼全体科室搬迁至国医馆。中医科现有医务人员19人，分别是中医师16人，康复医师1人，护理人员2人，其中正高5人，副高3人，中级4人，中医科重视人才梯队建设，已逐步形成一支结构合理业务水平较高的中医专科人才队伍。科内现有两个名医工作室，分别是2020年5月份成立的"章勤名医工作室"，2021年7月增设"倪晓红名中医工作室"，目标是在上虞区内树立妇保院中医妇幼品牌。中医科负责院内中医门诊和病区的中医会诊，2020年5月开始中医科每日派中医师产科病房常规会诊，开展病区产妇熏蒸、小儿药浴等中医适宜技术进病房项目，产妇中药熏蒸开展良好。常年开展中药内服、中药外敷、中药熏蒸、中药药浴、中药灌肠、中药熏洗、针刺、灸法（督脉灸、宫寒灸、脐灸、雷火灸）、推拿、刮痧、拔罐、手指点穴、耳穴、挑治、贴敷、神经阻滞封闭等治疗项目。