儿外科创建于1995年舟山妇幼保健院改制，历经20年发展，门诊及住院患儿逐年增长，成为舟山市唯一为本岛儿童服务的儿外专科。目前学科有专科医生4名。学科主任丁文雄，副主任医师。儿外科擅长于各种儿外疾患，包括儿童普通外科及泌尿外科的常见疾患、儿童各种常见病、多发病的手术治疗，以及各种儿童外科有关的急诊处理，每年就诊人次在5千余例，开展各类儿外手术600余例，包括常见先天性疾患、小儿疝气、隐睾、鞘膜积液、包茎、先天性甲状舌骨囊肿、皮样囊肿、淋巴血管瘤、尿道下裂、小阴茎整形，先天性多指并指等畸形矫正、先天性髋关节脱位筛查矫治、先天性唇裂修复、各种门急诊创伤修复，婴儿先天性畸形如幽门梗阻、无肛、肠道畸形、肾积水、外生殖器畸形的筛查与矫治。学科与上海杭州等国内知名儿科医院建立了广泛的业务联系，上级医院专家频繁来本院进行高难度专科手术，为舟山本岛儿童的救治提供了极大方便，社会反响好。