中山医院生物医学研究中心（ZS-BMRC）其前身是成立于1996年的实验中心。中心设有体内研究中心、细胞和分子生物学中心、临床生物信息科学中心、其中包括活细胞动态工作站、临床芯片实验室、组织样本库、分子免疫和分子病理平台、临床表观遗传学实验室、细胞超微结构室等数十个合乎规范的实验分室和150台（套）仪器设备。与上海市器官移植重点实验室、上海市临床生物信息学研究所紧密合作，共享资源。中心实行主任负责制。中心主任王向东博士是复旦大学附和中山医院特聘教授、呼吸科教授、博士导师、复旦大学临床生物信息学研究中心主任、上海市临床生物信息学研究所所长、英国伦敦国王学院兼职教授。他还任英国临床转化医学杂志主编(www.clintransmed.com),转化医学杂志疾病生物标记物专刊主编(www.translational-medicine.com)，临床生物信息学杂志主编(www.jclinbioinformatics.com)，和多个包括美国呼吸细胞分子生物学杂志(AmericanJournalofRespiratoryCellandMolecularBiology)在内的国际医学杂志编委。中心制定了多项规章制度，实行"制度化、规范化、专业化、科学化、标准化"的管理，保证实验室各项工作严格、规范、高效、合理的进行。新的管理体制在资源共享、资金使用及人员调配上都体现出明显的优势，大大提高了办事效率，特别是为实验教学的综合改革、实验室开放、科研保障和服务社会建立了必要条件。体内研究中心是经上海市动物管理委员会审核许可保存和饲养小型和大型动物并附有手术室，采样室和消毒设施。细胞与分子生物学中心配备齐全细胞和分子生物学科研相关设备。临床生物信息科学中心致力于组织标本储存，临床生物信息学，基因组学和蛋白质组学的临床应用和开发。卓越中心（COE）主要致力于RNA&DNA相关研究，二代测序平台的搭建工作。中心有近40人，其中教授3人，副教授2人，博士2人，硕士及本科18人，和其他平台支持人员。中心面向全体医疗、研究人员以及研究生，从"求服务、求发展、求生存"到"创服务、创发展、创辉煌"，共带教2000余名医生和研究生，承担和协助完成500余项研究课题。成为了一个以高品质的服务，先进的生物技术，成本效益的经营，公开透明的管理，及高效产出的生物医学研发的国际化平台。中心加强与国内外科学家和院校交流和合作，加速科学成果的产出，提升中山的研发声誉，吸引更多的科学项目和投资。中心承担多学科、多专业、多层次、多方向的实验教学任务，与国内外知名的生物医疗企业合作，为院、校、市提供了大量的人员培训和技术服务，实现资源共享和提高利用率。中心在建设过程中，强化以医疗、研究者以及研究生为本的观念，不断探索和建设具有特色的实验研究体系，探索更科学合理的科学研究模式，完善各种考评体系，建设高素质实验团队，不断提高带教质量，进一步完善实验室管理机制和信息化水平，提升科研实力和服务地方的能力，建设具有示范作用的和高水平的化学实验教学平台是中心今后的奋斗目标。