消化内科是衢州市医学重点学科，拥有高级职称9人，硕士4人。设有消化科病房、消化专科/专家门诊，消化内镜中心工作单元等。配备高清晰度电子胃镜、电子肠镜、电子十二指肠镜、专用X光造影机、胶囊内镜、超声内镜、氩气刀、高频电刀、微波治疗仪等先进设备。常规收治消化系统的各类常见病、多发病及疑难危重疾病。成功救治了大量消化系统急、危、重症患者，如消化道大出血、重症急性胰腺炎、肝硬化肝性脑病、胆道感染休克等。常规开展胃镜、肠镜检查、胶囊内镜检查、无痛肠镜和胃镜、术中内镜、内镜下异物取出术、逆行胰胆管造影、胆道取石术、鼻胆管引流术、胆道及胰管内支架置入术、消化道息肉和肿瘤的内镜下摘除、消化道狭窄的扩张术及内支架置入术、食管曲张静脉破裂出血的套扎及硬化治疗等多种介入治疗技术，进行小肠镜、超声内镜检查。危重病症的抢救治疗和内镜下治疗技术保持地区领先水平。