神经内科是衢州市医学重点建设学科，是本地区脑血管病防治中心、脑血管急危重症疾病的诊治和救治中心。拥有高级职称6人，硕士6人，学科带头人1人。配备3.0T超导核磁共振（MRI）、螺旋CT、血管造影机（DSA）、睡眠视频脑电图仪、二十一导联数字脑电图仪、经颅多普勒以、诱发电位/肌电图仪等先进仪器设备。科室在急性脑血管疾病、中枢神经系统感染、重症肌无力、癫痫、帕金森病等危重症的抢救方面积累了丰富的经验。特别是在卒中治疗方面，设置卒中单元，开辟急性脑血管病抢救治疗的各种措施。对符合溶栓条件的超急性期缺血性脑卒中患者进行溶栓治疗。有完善的康复中心，能全面、系统的对卒中后患者进行肢体康复、语言训练、心理康复和健康宣教。