眼科中心是衢州市医学重点建设学科，防盲治盲指导中心、糖尿病性眼病防治中心，"光明与您同行"衢州市白内障复明慈善基金定点手术单位。拥有高级职称7人，硕士3人，市115人才2人。配备先进的眼科检查和治疗设备，如蔡氏彩色照相机、1.8mm同轴微切口白内障超声乳化设备Stellaris(视特瑞视觉提升系统)、Storz超声乳化仪、海德堡第四代频域OCT、超声生物显微镜（UBM）、顶级进口显微镜(蔡司、莱卡等)、免散瞳眼底照相机、对比敏感度计等。科室开展角膜移植、有晶体眼人工晶体植入、白内障超声乳化（1.8mm同轴微切口白内障超声乳化、3.0mm白内障超声乳化）、可折叠人工晶体植入、可调焦人工晶体植入、小切口非超乳+人工晶体植入、常规的白内障囊外+人工晶体植入术以及复杂的白内障手术、青光眼手术、斜视（共同性、非共同性斜视）手术、视网膜脱离修复手术、复杂性视网膜玻璃体手术、泪道手术、眼底激光、前节激光（后发行白内障、青光眼激光）、眼眶肿瘤、眼部整形等手术。开展规范系统的弱视治疗、屈光不正矫正、眼外伤手术、干眼症、中西医结合眼病等治疗。其中23G微创玻璃体切割术、1.8mm同轴微切口白内障超声乳化术、内镜下泪囊鼻腔吻合术、视神经管减压术、眶壁骨折整复术等为中心的特色技术。