临床药理研究室是医学研究部从事临床药理学和心血管转化医学研究的主要部门。临床药理研究部现为广东省临床药理学重点实验室，同时也是广东省冠心病研究所重点实验室和广东省结构性心脏病研究重点实验的组成部分，国家药物临床试验机构I期临床研究室的承担部门和广东省临床药理研究所的主体,也是华南药物临床评价中心（省科技厅主管）的依托部门。前身临床药理室是华南地区创建最早的临床药理学研究单位之一，成立于1983年，实验室具有较好的工作基础和实验条件，先后对国际临床药代动力学的三大前沿课题（药物活性代谢物的研究、药代—药效学结合研究、药物对映异构体的研究）进行探讨，并率先开展了分子临床药理学研究，将临床药理学的独特优势与分子生物学的新技术有机地结合起来，在β受体信号转导、细胞因子、基因与干细胞治疗工程等领域开展创新性研究，显示出巨大的发展潜力。最近更添置了高效液相色谱－质谱仪（HPLC/MASS/MASS）和激光共聚焦显微镜（Confocal）两个重点平台。生物医学工程研究室现设有心室辅助循环实验室和组织工程实验室。可以开展心室辅助装置的开发和临床试用、组织工程生物反应器的制作、心血管组织工程的设计和制备等工作。目前研究工作主要集中在心肌组织工程的研究及心室辅助装置小型化的开发。近五年来实验室承担了国家自然科学基金、国家"十五"、"十一五"攻关项目、卫生部科研基金、省自然科学基金、省科委攻关项目、省医学科研基金20余项、承担新药临床前药理、毒理学研究和生物利用度与生物等效性研究40多项，并全部通过国家有关部门的评审。获卫生部医药卫生科技进步二等奖1项；广东省科学技术一等奖1项，二等奖3项；广东省医药卫生科技进步一等奖1项，二等奖2项，三等奖3项。发表SCI文章70多篇。