中医科是中山大学孙逸仙纪念医院一级临床科室，是全国综合医院中医临床示范单位，广东省中医老年病重点专科，南方中西结合老年病防治联盟单位，国家临床药物试验基地。学科带头人李建军教授现担任广东省中西医结合学会亚健康专业委员会副主任委员，广东省中西医结合学会自然疗法专业委员会副主任委员，广东省癌症康复学会副主任委员，《中药材》和《环球中医》等杂志编委。中医科由中西医结合病区、中医内科门诊、中医针灸科和中医骨科组成。现有教授1名，副教授5名，硕士导师5名，主治医师11名，住院医师5人。其中博士后1人，博士（含在读）11人，硕士5人。中医科以大综合小专科为特色，中西医结合病房和中医门诊涵盖了心脑血管疾病、恶性肿瘤、老年病、呼吸系统疾病、各种妇科疑难杂症、不育症、及疑难重症中西医结合临床和研究工作，针灸科运用针灸和中药治疗各类疼痛、脑血管疾病康复、神经损伤恢复、瘙痒症和免疫性炎症、调经助孕、消化系统疾病以及肿瘤手术和放化疗后综合治疗。骨科擅长以手法及中西医结合治疗脊柱病变引起的颈、肩、腰、腿、膝痛及相关疾病，以及外伤所致的骨折、脱位、伤筋等疾病。中医科秉承中医文化，弘扬中医特色，坚持中西医结合，不断开拓创新，精修仁心仁术，维护患者心身健康。我科是广东省中医药局"十三五"重点专科、南方中西医结合老年病防治联盟单位、全国综合医院中医药工作示范单位、广东省中西医结合学会亚健康专业委员会副主委单位、广东省癌症康复学会副主委单位、广东省中西医结合学会自然疗法专业委员会副主委单位。