广东省中医院肛肠科成立于1956年，是省内最早成立的肛肠学科，是全国第一批肛肠专业国家新药临床试验(GCP)基地，是国家中医药管理局重点学科建设单位和广东省中医药管理局重点专科，是中国南方PPH协作中心暨中国南方PPH培训基地和中国南方腹腔镜结直肠外科协作组单位。担任中华中医药学会肛肠分会副会长、中医药高等教育学会临床教育研究会肛肠分会副主任委员、广东省医学会结直肠肛门外科学专业委员会副主任委员、广东省中西医结合学会大肠肛门病专业委员会副主任委员，是广东省中医药学会肛肠专业委员会主任委员挂靠单位。学科突出以结直肠、肛门疾病诊治为特色，在结直肠癌、肛门良性疾病如痔病、肛裂、肛瘘、肛周脓肿、直肠脱垂等以及功能性便秘、炎症性肠病、骶前肿瘤的诊断治疗及肠造口护理等领域积累丰富的临床经验。拥有高清和3D腹腔镜、超声刀、电子肠镜、直肠镜、生物反馈治疗仪、肛肠动力分析仪、腔内超声等一系列专科设备。目前本学科拥有60张床位（含珠海医院），年门急诊量超过8万人次（含珠海医院），年住院人数超过3500人次，年手术台次超过2000台。其中每年完成结直肠癌根治手术200多例，可开展腹腔镜大肠癌微创手术、直肠癌全系膜切除术（TME）、直肠癌（超）低位保肛手术、直肠癌侧方淋巴结清扫术、联合脏器切除术以及经肛门显微镜手术（TEM）等。学科发扬传统医学诊疗特色，重视围手术期中医中药的干预以及中医特色疗法的应用如挂线疗法、拖线疗法、注射固脱技术、热奄包热敷疗法等传统中医适宜技术。此外，针对临床常见的各种良性肛门病，合理订制手术方式，配合优化管理方案，手术力求精细，减少创伤，匹配全程管理措施，从而达到术后患者痛苦小、并发症少、住院时间短的快速康复学科目前医护人员44人（含珠海医院），其中正高职称2人，副高职称7人，中级职称12人，硕士19人，在职博士1名，全国肛肠名家1名,全国名老中医继承人2名。本学科是全省最早的肛肠专业硕士研究生招生点，承担临床、科研、教学任务。现本学科有硕士生导师3人，其中中医外科学专业2人，中西医结合外科学专业1人，累计共培养毕业研究生32人，在读研究生8名。每年接收省内外进修医生约15人，其中超过一半来自三甲医院，为省内以及国内各地区培养了一批肛肠科骨干成员。目前承担省部级课题1项、厅局级4项，科研经费近10万，5年来在各级学术刊物上发表文章近50篇，参编专著《中华结直肠外科学》1部，参编教材《中西医结合外科学》1部。