外科是医院一级科室，共分珠玑路总院及同德围分院两个病区，目前拥有门诊、住院、手术、功能检查四个业务单元，设有普外、泌外、乳腺、神外等专科，拥有主任医师3名、副主任医师8名等各级医护人员。科室拥有多个省市重点专科，广东省"十二五"中医重点（特色）乳腺专科、广东省"十三五"中医重点胃肠专科、广州市重点中医男性专科，广州市重点中医胃肠专科培育单位等。科室拥有最先进的Stryker和OLYMPUS腹腔镜、胆道镜及十二指肠镜系统、ERBE外科超级工作站、TELEA分子共振射频刀、微波消融系统、经尿道前列腺电切镜系统、第三代EMS气压弹道腔内碎石机、智能尿流动力学检测仪、各式膀胱镜、输尿管镜和肾镜、精子自动检测分析、麦默通乳腺微创旋切系统、乳管镜、百胜高频乳腺彩超机、钬激光碎石系统、快速冰冻切片机、彩色图文分析仪、红外线扫描仪、乳腺微波与红外线治疗仪等先进设备。普外专科常规开展胃肠道良恶性肿瘤切除术、肝胆手术及甲状腺肿瘤切除术、疝气手术。特别在微创腹腔镜方面开展：腹腔镜下结直肠癌根治术、疝修补术、胆囊切除术、阑尾切除术、甲状腺切除及微波治疗等手术。泌尿外科常规开展前列腺电切术、泌尿系结石微创治疗、泌尿系肿瘤根治术、前列腺癌根治术等。提倡中西医结合微创治疗前列腺增生症和泌尿系结石，具有诊断迅速准确，治愈率高，不易复发等优点。乳腺专科常规开展乳腺各类良恶性病变手术，如应用微波消融系统进行乳腺等良性病变微创治疗，麦默通乳腺微创旋切治疗乳腺良性肿瘤，乳腺导管内窥镜治疗导管内病变，常规开展前哨淋巴结活检术、乳腺癌根治术。科室本着"中医学术站在前，现代医学过得硬"的发展理念，坚持以中医为特色、结合现代医学诊疗手段，对各种外科常见疾病进行诊断、鉴别诊断，为病患提供更方便、更有效、更有特色的治疗方法。