病理科是以医、教、研为核心的医技科室，由组织病理室、细胞病理室及分子病理室三部分组成。病理科是医院四大"品牌学科"之一，并于2018年获得深圳市"医疗卫生三名工程"项目，引进"四川大学华西医院步宏教授肿瘤病理学团队"，享有国内一流的肿瘤病理诊断、分子病理及数字病理专家团队指导。科室现有医技人员共29人。其中，医生13人，主任医师3人，副主任医师1人，主治医师4人，住院医师5人；技术员13人，副主任技师1人，技师3人，技士9人；研究实习员2人；博士6人、硕士10人；硕士生导师2人；科室辅助人员1人。科室人员承担并参与多项国家级、省部级科研课题，在国家级、省级及市级学术团体中担任许多重要学术职务，包括中华医学会病理学分会胸部疾病学组副组长、中国医师协会病理科医师分会委员、中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会委员、中国临床肿瘤学会肿瘤病理专家委员会委员等。担任《中华病理学杂志》、《临床与实验病理学杂志》等多家期刊的编委及审稿人。目前，病理科以第一作者或通讯作者发表论著10余篇，其中SCI论文5篇。特色技术目前已开展活检、术中冰冻及手术标本的组织病理检查，脱落及细针穿刺细胞病理检查，荧光原位杂交（FISH）等分子病理检测。2019年共完成各类临床病理诊断16700余例。科室除承担院际间疑难病理会诊外，还作为院内肿瘤多学科综合诊疗（MDT）的重要成员，参与临床各学科疑难病例讨论，为临床制定治疗方案提供依据。科室拥有国内先进的全自动HE染色机、全自动免疫组化仪、宫颈细胞学电脑辅助阅片系统、一代测序仪、荧光定量PCR仪、Bio-Rad凝胶成像仪、数字切片扫描仪等先进设备。