医疗立院、教育兴院、科技强院"是南方医科大学深圳医院的主要办院方针。临床医学创新中心（中心实验室）是在大学和医院各级领导关怀下，由深圳市发改委批复建立的基础医学、临床转化、精准医学为一体的综合性平台，是深圳市病毒肿瘤学重点实验室和深圳市数字外科3D打印重点实验室，肩负着全院医、教、研均衡发展的重任。建设总面积3034平方米，分布于行政楼2、3楼、综合楼4楼和原高压氧1楼，一期设备投入2980万元，二期还将投入2500万元。规划了基础研究部、精准医学部、转化医学部和动物实验部。