华中科技大学协和深圳医院感染科成立于1993年，是深圳西部最大的感染性疾病诊治中心，肩负着南山区及周边地区传染病医疗、教学、科研、预防和保健指导等任务，负责南山区各医院感染性疾病会诊及诊治指导工作。科室拥有总建筑面积约8400㎡的感染楼和位于门诊综合楼的肝病中心，共有87+15张病床，其中6间负压病房，收治各种传染病及复杂感染性疾病，下设有感染科门诊、感染科一区病房(肝病中心)、感染科二区病房(感染楼)、感染科实验室（深圳内源性感染诊治研究重点实验室）和医院感染管理科；开设有发热门诊、肠道门诊、感染肝病门诊、便秘微生态门诊、脂肪肝体重管理门诊及感染科专家门诊。目前在院长兼学科带头人邓启文主任医师的领导下，拥有临床医生16人，其中博士4人，硕士10人；高级职称8人，中、初级职称8人。自2003年以来，科室大胆创新，在临床、科研和教学三方面均大踏步向前发展。临床方面，先后开展了肝脏活体组织穿刺术、乙肝病毒、丙肝病毒定量检测、乙肝病毒前C区变异、YMDD变异基因检测等项目，对各型病毒性肝炎、肝硬化及各种原因引起的肝损害（酒精性、药物性、血吸虫、肝吸虫等）的诊断治疗，乙肝、丙肝抗病毒治疗，尤其是重型肝炎的早期治疗等方面积累了丰富的临床经验；对重型肝炎的抢救成功率达60%以上，达到了国内先进水平。在发热待查、黄疸待查、皮疹待查及各类难治性感染等疑难杂症的诊断及治疗方面积累了丰富的临床经验。并联合兄弟科室开展了肝癌的介入治疗，肝衰竭的人工肝支持技术治疗等，均取得了很好的疗效。科研方面,感染科承担了国家自然科学基金、广东省自然科学基金、深圳市科创委、深圳市科技局、深圳市卫计委及南山区科技局项目等科研项目，科研经费充足。科研队伍强大，专职实验人员现有11人，其中博士后3人，硕士4人。科研平台实力雄厚，科研场地750m2，拥有P2+实验室，科研实验设备精良，拥有包括高分辨质谱色谱联用仪、纳米级超灵敏信号转导通路分析系统、全自动蛋白质印迹定量分析系统、纳米颗粒跟踪分析仪、小动物断层扫描及成像系统、高通量基因检测平台、高内涵细胞成像和分析系统、全自动分析杆菌检测系统等先进仪器设备。目前正在进行分子克隆及细菌耐药与生物膜研究、代谢组学和蛋白组学研究、纳米颗粒的制备、表征以及纳米平台的构建等研究，均处于全国先进行列。感染科2009年被评为深圳市南山区重点学科，2011年被评为深圳市医学重点学科，2013年感染科实验室更被授予深圳市内源性感染诊治研究重点实验室，2013年被授予广东省临床重点专科，目前整体水平已经符合三级甲等医院感染科的诊疗要求，诊疗技术已达到三甲医院重点专科水平。同时，感染科还是广东省卫生厅医院感染控制质量监测单位之一，也是广东省细菌耐药监测网成员之一，更是卫生部NDM-1监测点之一。感染科在多次突发公共卫生事件及重大传染病的防控中发挥了桥头堡的作用。2003年SARS肆掠华夏时，科室坚定地接受了政府交给的甄别及防治SARS的任务，全科上下众志成城，以优良的医疗技术水平和无畏的精神气概顺利完成了防治SARS的重任,科室因此荣获广东省抗击非典先进集体，南山区抗击非典模范集体，邓启文院长荣立广东省抗击非典二等功，深圳市抗击非典二等功，南山区抗击非典一等奖。2009年6月，感染科被市卫人委指定为深圳市甲型H1N1流感筛查定点科室，在卫生部防控甲型H1N1流感的督导检查中获得好评。2020年新冠疫情爆发后，科室全体医护人员在邓启文院长和余治健主任的带领下，同心协力，坚守抗疫第一线，积极投身抗击湖北疫情、防境外输入、复工复学复查三大战役，科室李多云医师更是主动支援武汉抗疫，彰显了感染科医师的高尚风范，并获得了省级表彰，另科室7人获得了市级表彰。如今的感染科，犹如插上了腾飞的翅膀，本着"以病人为中心，用科学的态度，精湛的医术和高尚的医德为患者提供优质的服务"的宗旨，在邓启文院长、余治健主任的带领下，全体医护人员齐心协力、勇于开拓、锐意进取，全面提高服务质量及科研技术水平，全力以赴迎接新的挑战。