香港大学深圳医院康复医学科主要提供以下疾病康复服务：骨关节疾病、腰腿痛及颈椎病、腰椎间盘突出症、肩周炎、关节置换术后、骨折后及骨关节其他手术后、运动创伤、脑瘫、神经系统疾病及伤残、面神经麻痹、脑血管意外（偏瘫及其他残疾）、脊髓损伤（截瘫，四肢及其他残疾）、周围神经疾病及损伤、脑外伤后遗症、肿瘤、唇腭裂术后等康复评定以及治疗服务。康复医学科参考了香港康复治疗模式，以现代康复技术为特色，以"全人康复"理念为患者提供全面系统的康复评定与治疗服务。下设有康复科病区、物理治疗部、作业治疗部、言语治疗部。康复医学科门诊及各个治疗部位于国际医疗中心V栋负一楼，占地面积为2940平方米，拥有上百件专业的康复治疗设备，并于2019年引进了广东省第一台现代层流阻力运动康复水疗池，可以满足各个不同阶段患者的康复治疗需要。康复医学科病区位于C栋，占地面积为2250平方米，开放康复床位60余张。康复医学科拥有专业化的医疗团队，采用"团队合作"形式为患者提供服务。根据患者病情不同阶段采用相对应的康复方案，从康复护理、康复医疗、康复治疗以及家庭回归支持等多层次提供服务。现有医生7人，治疗师30人，护士16人。均为经过层层筛选的精英型医疗人才。团队以"全人康复"理念为患者提供全面系统的康复评定与治疗服务，旨在帮助患者早日回归正常家庭生活和社会生活。