深圳市妇幼保健院生殖医学中心位于福强院区，成立于1999年，是全市最早成立的同类科室之一，2006年获夫精人工授精(IUI)准入资质，2011年获体外受精-胚胎移植(IVF-ET)准入资质，2019年获胚胎植入前遗传学检测（PGT）准入资质。目前开展以不孕不育相关的多项诊疗技术，如夫精人工授精、常规体外受精-胚胎移植(第一代试管婴儿)、卵胞浆内单精子注射(第二代试管婴儿)、胚胎植入前遗传学检测(第三代试管婴儿)、胚胎冷冻保存及复苏、精子冷冻保存及复苏、经皮睾丸取精术、未成熟卵母细胞体外成熟培养、选择性减胎术等，均已成功应用于临床。近年来试管婴儿周期数逐年上升，连续三年临床妊娠率可达55％以上，居国内外先进水平，已诞生数千名婴儿，为不孕不育夫妻圆梦。生殖中心占地面积1500平方米，现有医护人员35人，其中硕士生导师1人，孔雀人才1人，博士后2人，拥有博士学位的13人，硕士学位的10人。并积极推动科研工作，累计获深圳市政府科技创新奖1项、ASRM生殖医学手术奖2项、Royan国际生殖医学研究奖1项、ASRM基础研究奖1项。承担国家自然科学基金1项、省级课题和深圳市科创委等多项课题；发表SCI收录论文15篇，中文核心期刊论文100余篇。2015年引进哈佛大学贝斯以色列医院JohnYeh院士生殖医学团队，与哈佛大学医学院建立战略合作关系，共同筹建"哈佛-深圳生殖医学中心"，在医教研等方面展开合作。