中国科学院大学深圳医院眼科由东、西两个院区眼科构成，人员结构合理，技术力量雄厚，医疗设备先进，具有各种眼科常见疾病的诊治能力及抢救能力，对于眼科常见病、多发病诊治技术娴熟，长期有临床经验丰富的主任医师、副主任医师坐诊。眼科年收治住院患者800人次，诊治门诊患者7万人次，完成手术600台。眼科始终秉承"以患者为中心，保障患者眼睛健康，营造心灵之窗"，竭诚为广大患者服务。床位数：眼科共有床位20张。人员结构：眼科医护人员共18人，其中主任医师2人，副主任医师3人，主治医师3人，住院医师3人，验光师3人，主管护师2人，护士2人。配套设备：眼科：电脑验光仪、综合验光台、非接触眼压计、角膜曲率仪、IOL-master、弱视治疗仪、蔡司全电脑视野计、蔡司眼底激光治疗仪、蔡司眼底照相机、光学相干光断层成像扫描（OCT）、眼部A超机、白内障超声乳化仪、蔡司手术显微镜。诊疗范围：常规的眼科检查及治疗：验光配镜；眼前、后节照相；眼底血管荧光造影；眼前、后节光学相干断层扫描（OCT）；人工晶体度数测定；斜视度数测定；干眼相关检查等。开展的手术有：眼部整形美容术；眼睑下垂矫正术；倒睫矫正术；眼睑、眼眶肿瘤切除术；各种泪道疾病手术；翼状胬肉切除联合角膜缘干细胞移植术；结膜、角膜肿瘤切除术；结膜瓣遮盖术；青光眼减压术；白内障超声乳化联合人工晶体植入术；白内障摘除联合青光眼减压联合人工晶体植入术；无晶体眼的人工晶体植入缝线固定术；眼前节玻璃体切割术；眼表、眼内、眶内异物取出术；眼底激光光凝术；各种眼外伤手术等。