泌尿外科是同济医院特色学科，教育部硕博士学位授予点，是具有国家药物临床试验资质的专业科室，住院医师规范化培训基地。拥有前列腺疾病、泌尿系结石、泌尿系肿瘤、尿道外科、泌尿生殖男科等5个亚学科。学科带头人吴登龙教授是上海市医学会泌尿外科专科分会委员、上海市中西医结合学会围手术期专业委员会常委、上海市性教育协会男性健康教育专家委员会副主任委员。科室有主任医师5人，副主任医师3人。科室在泌尿系统肿瘤、泌尿系统结石、前列腺增生症、尿道狭窄的诊断治疗中有显著特色。目前采用先进3D腹腔镜技术治疗泌尿系统肿瘤；输尿管镜、输尿管软镜、经皮肾镜治疗泌尿系统结石在上海市处于领先水平；在上海市率先开展红激光汽化消融技术治疗前列腺增生。主持国家自然科学基金等国家及省部级课题8项。科室派遣多名医疗骨干赴美国梅奥医学中心深造学习，并与美国密歇根大学医学院、美国罗切斯特大学医学院、美国约翰霍普金斯大学医学院、哈萨克斯坦那扎尔巴耶夫大学医学院建立了广泛学术交流与合作。