病理科是医院特色学科，教育部硕博士学位授予点。病理科下设病理诊断室、细胞室、免疫组化室、病理技术室和分子病理室等。学科带头人易祥华教授是上海市医学会病理专科委员会副主任委员,中华医学会病理分会胸部疾病学组委员、中国合格评定国家认可委员会医学实验室评审员。科室拥有主任医师1名，副主任医师2名。年完成组织病理诊断4万余例、细胞学诊断2万余例、术中冰冻病理诊断2千余例。科室开展免疫组化、特染、基因突变、荧光原位杂交、基因重排、DNA倍体分析和循环肿瘤细胞等检查技术。其中开展的CRP方法诊断间质性肺疾病在国内处于领先水平，承担全国各地呼吸系统疑难病理会诊工作。科室以间质性肺疾病、呼吸和消化系统肿瘤、淋巴瘤为主攻科研方向。主持国家自然科学基金、国家卫生计生委和上海市自然科学基金等课题9项。发表学术论文210余篇，SCI收录论文50余篇，主编和参编医学专著11部。作为主要完成人获得上海市科技进步三等奖、上海市医学科技奖三等奖、上海市医学科技成果推广奖。