惠州市第三人民医院康复医学中心设住院部和门诊部。其中住院部分神经康复病区（一区、二区）和骨科康复病区，开放床位120张。中心是广东省康复医学临床重点建设专科、惠州市康复医学临床重点专科、惠州市中医针灸推拿重点专科、惠州市工伤康复定点医疗单位、惠城区肢体残疾技术指导中心；广东省针灸学会康复专业委员会主委单位（全国"五一"劳动奖章获得者、惠州市"名中医"陈小凯副院长任主任委员）。康复医学中心治疗专业分工精细，设有运动治疗区、作业治疗区、言语（吞咽）治疗区、物理因子治疗区、针灸区、推拿区、骨科康复区、儿童脑病康复区、肺康复治疗区、心脏康复治疗区、盆底康复治疗区、音乐治疗区等12个治疗区；并成立口颜面、手功能、步态、营养管理等学组。中心拥有主任医师1名、副主任医师3名、副主任技师1名、中级职称医技人员13名、硕士研究生6名、本科以上治疗师15名。中心技术力量雄厚，注重传统针灸与现代康复相结合，争取疗效最大化。中心有省级立项课题3项，市级立项课题9项，国家级"十一五"科研分中心课题1项；获得市级科技进步三等奖1项；以第一作者在核心期刊发表论文5篇，SCI论文1篇，取得了科研临床相互促进的良好效果。中心秉承医学严谨、求实创新、精益求精的理念，以"多专科、多学科协作，团队合作"的工作模式，"中西医结合康复"的诊疗特色，采用专业分工精细的多种康复治疗技术，并在全市首创"康复之家"医患交流平台，落实随访制度，力求为广大民众提供更优质、更满意的康复服务。