神经内科是黑龙江省第二医院一级重点学科之一。科室主要从事神经内科、中毒、新陈代谢等相关疾病的诊断、治疗及科研工作，能够救治脑出血、脑梗死等脑血管疾病及各种神经内科疾病几十种。同时患有脑血管病和糖尿病、高血压、高尿酸血症的病人在我科治疗更系统、更全面、更省时，第一时间为病人提供了便捷的服务，缩短病人的住院时间。科室在脑出血病人中采用局部亚低温疗法减轻了急性期脑细胞损伤，使病人尽快得到功能恢复。针对缺血性脑血管疾病，在药物治疗的基础上，配合康复治疗仪、针灸等综合治疗措施取得了满意的治疗效果。科内配有多台胰岛素泵，为糖尿病人的治疗提供有力保障。科室脑电图仪为国内一流设备，为癫痫病的诊断提供了方便条件，可进行动态脑电图的检查。24小时动态心电监护为心律失常病人的诊治提供了理论基础。