二四二医院药学部按着《药品管理法》及相关法律、法规和医院管理的规章制度，具体负责医院的药事管理工作，承担全院临床用药的供应、调剂和静脉配置，同时还结合临床开展临床药学工作，实施各项药学技术服务。2008年获得了哈尔滨市不良反应检测先进集体荣誉称号。药学部现有各级药学专业技术人员50人，其中主任药师1名，副主任药师6名，主管药师27名，硕士学历2名，本科学历14名，大专学历17名。药学部作为医院重要的医技科室，下设有临床药学室、中西药住院调剂室、静脉配置中心、门诊静脉配置中心、中西药门诊调剂室、中西药库、输液库、制剂室、中药煎煮室等21个二级科室，有一整套完整的工作制度和质量保证体系。对药品实施严格的质量监督，为患者用药安全有效提供了有力保证。临床药学室建立"以病人为中心"的药学管理模式，开展以合理用药为核心的临床药学工作。配备了专科临床药师，参与临床查房，与医生护士结成药物治疗团队，以患者为中心，以帮助患者合理用药为宗旨，全心全意开展药学服务。开展了临床用药评价、处方评价、药物不良反应检测、杳无信息咨询、抗菌药物临床应用等专项活动，强化药品风险意识，规范抗菌药物应用，促进临床合理用药。定期编辑发行《药学通讯》、《处方集》，及时提供各类药物咨询。静脉配置中心（PIVAS）是参照《药品生产质量管理规范》（GMP）和国内相关标准设计并建筑的，于2010年3月建成并投入使用，净化面积150平方米。在PIVAS，药师将检验审核输液各组分之间有无配伍禁忌及配伍的合理性，通过多重审核配制药物，将使用药物错误降到最低。同时大大降低污染的发生率，最大限度地减少输液反应。