曙光医院肛肠科历史悠久，最早发源于1956年由沪上痔科名家陈泽超主持的痔科门诊；1990年，曙光医院在上海地区首先设立中医肛肠科；1992年，曙光医院肛肠科被定为上海市肛肠病医疗协作中心。历经陈泽超、柏连松、杨巍三代带头人的培育栽植，曙光医院肛肠科逐步成为享誉本地区乃至全国的特色专科。肛肠疾病的治疗中心：东西两部均设有规模相当的病区，有普通病房和特需病房满足患者的多样化需求，科室现有医师19人：其中主任医师3人，副主任医师8人；博士生导师1人，硕士生导师3人，博硕比例达到75%以上。曙光肛肠科年门诊量80000余人次，年手术量5000余台，疾病确诊率、治疗质量、中医整体护理效果和预后等指标在上海均处于领先地位。肛肠新技术培训中心：自2006年起连续举办10届《曙光中西医结合肛肠论坛暨肛肠疾病高级研修班》，2011年成立中国TST技术培训基地，2014年成立中国RPH技术培训基地，每年开办技术学习班2次，通过手术演示及理论学习等方式培训及指导专科医师，形成上海乃至整个华东地区的肛肠新技术培训中心。肛肠药物及临床研究中心：国家中医药管理局"十三五"重点专科，上海市中医特色重点专科、上海市中医临床优势专科、上海市中医专科联盟肛肠病专科负责单位。近年来承担国家科技部"十一五"项目2项"十二五"项目1项；国家中医药管理局项目1项；国家自然基金面上项目2项；上海市科委、教委、卫生局等科研课题30余项，编撰专著15部；发表论文50余篇，曾获国家、部市级科技进步奖6项，完成中药特色制剂成果转让2项。