曙光医院是沪上第一批引入白内障超声乳化技术的眼专科，经过近二十年的发展，白内障手术水平已在业界享有较高声誉。白内障青光眼专科在白内障手术领域不断探索屈光性白内障的个性化治疗，并具有处理各种复杂白内障、硬核白内障、高度近视并发白内障、青光眼及葡萄膜炎并发白内障、外伤或先天性白内障、晶状体脱位、二期人工晶体植入以及人工晶体置换、伴有眼底病及角膜病的白内障等的诸多能力；眼底病专科除开展各类玻璃体视网膜手术外，拥有眼底荧光血管与脉络膜血管同步造影、OCT等先进仪器，对复杂疑难性脉络膜视网膜炎以及葡萄膜炎等眼底疾病的中西综合治疗具有丰富经验。2005年始东西两院联动发展，开展玻璃体手术，成为中医药大学系统唯一具有眼后段手术能力的眼专科。科室在"目以气为用，目以血为养"的理论思想指导下，关注眼病过程中气血的维护和调养，在手术后的血-眼屏障重建和视功能康复方面经验丰富。对于高复发性的眼病如葡萄膜炎、角膜炎、视神经炎，采用中西医结合治疗以减少复发、减轻激素的副作用；在眼底病中采用中药联合光凝以减轻网膜水肿、改善眼底微循环，起到标本兼治的作用。科室积极探索、挖掘整理中医外治疗法，结合医院综合治疗室平台，采用多种传统治法改善视疲劳，使大量患者受益。目前拥有高级职称8人，博士4人。拥有国家自然科学基金3项，上海市三年行动计划1项，各类各级别科研项目12项，涵盖了眼表病、眼底病、屈光、围手术期等多个领域，总经费近120万元。近五年共发表SCI论文1篇，核心期刊论文20余篇。有4人入选"上海首批青年医师培养资助计划""杏林新星""中西医结合人才"等人才培养计划。