风湿免疫科是"内蒙古自治区草原英才创新人才团队"、"内蒙古风湿与自体免疫病学领先学科"，和"内蒙古自治区免疫学专业医疗质量控制与管理中心"、"内蒙古自治区风湿免疫专科联盟理事长单位"；也是国家卫健委和药监局批准的"国家干细胞临床研究机构"和"国家药物临床试验基地"。早在80年代医院就已经开展了风湿病的研究，2005年王永福教授留美归国后，正式成立自治区首家风湿免疫专科，学科业务水平始终保持着国内先进水平和自治区领先水平，患者辐射范围东起黑龙江和内蒙古东部盟市，西至兰州、宁夏地区，为我国西部地区风湿免疫疾病的诊治做出了巨大贡献，在国内有较强的影响力。学科紧扣国家和自治区医改的总体方向，全面推进分级诊疗、双向转诊和医师多点执业工作。以内蒙古自治区风湿免疫专科联盟的建设为抓手，秉持"资源整合、提升管理、强弱联合，特色专科"的合作思路，创新性提出"名医工作室"、"博士工作站"建设工作，推进自治区风湿免疫专业的均衡发展，有效的解决了当地患者看病难的问题。科室开设了骨质疏松门诊、痛风门诊、免疫-妊娠门诊、免疫-间质肺与肺血管病门诊、狼疮门诊、干燥症门诊、腰背痛门诊、关节炎门诊、少见病罕见病门诊（疑难杂病）等专病门诊。主要诊疗疾病包括痛风、骨质疏松症、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、干燥综合征、脊柱关节病、骨关节炎、硬皮病、皮肌炎、血管炎等。