赤峰市医院作为内蒙东部区区域医疗中心，病理科在医疗、教学和科研方面做出了重要贡献。病理科年外检两万五千多例、术中冰冻三千多例、细胞学检查两万多例，且呈逐年增多态势。免疫组化染色作为科室常规外检普遍应用的诊断和鉴别诊断技术，可以做上百种抗体的染色，每年免疫组化染色片两万多张。目前病理分子实验室年检测样本量14000余例，检测项目十万余次，受检人群覆盖了整个赤峰及周边地区。自2007年担负整个赤峰地区法医尸检病理工作以来，共完成尸检病理225例，高质量协助办案机构查明死因、还原真相，深得各大办案机构信赖。承担着赤峰及周边地区疑难病理会诊工作，年会诊量近2000例。赤峰市医院病理科设有消化、软组织、淋巴造血、乳腺、女性生殖、内分泌肿瘤、泌尿、分子病理等12个亚专科，是内蒙东部区国家病理医师规范化培训基地和赤峰及周边地区病理骨干培训中心，目前正担负着病理住院医师规培任务。十年为赤峰及周边地区20家医院培养病理骨干24名，加强了这些医院的病理服务能力。长期为旗县区医院病理科提供技术支持和帮扶，在很大程度上带动了赤峰及周边地区病理事业的发展。近期科室发表论文30余篇，其中收录SCI文章4篇。目前所承担科研项目6项。获赤峰市科技进步奖两项。病理科服务项目包括：1、常规石蜡切片诊断2、术中冰冻诊断3、普通细胞学检查4、宫颈液基细胞学检查（TCT）5、免疫组化诊断6、特殊染色7、沉渣包埋8、人乳头瘤病毒检测（HPV）9、骨髓活检诊断10、肺癌EGFR基因检测（液相基因芯片平台）11、结直肠癌K-ras、B-raf和N-ras基因检测（液相基因芯片平台）12、H-erbB2、ALK、ROS-1（FISH检测）13、循环肿瘤细胞检测（CTC）14、新生儿遗传代谢病串联（高通量测序平台）15、肺癌10基因检测、肺癌15基因检测、结直肠癌12基因检测、多癌种化疗用药基因多态性检测19基因、肿瘤靶向化疗用药标准血检41基因、肿瘤靶向用药美标血检143基因、肿瘤精准治疗全面血检519基因、乳腺癌22基因、BRCA1/BRCA2遗传筛查、BRCA1/BRCA2用药筛查（NGS/一代基因测序技术）16、叶酸能力产前筛查（sanger测序技术）17、KIT及PDGFR检测（sanger测序技术）18、安全用药基因检测（sanger测序）19、尸检病理20、免疫荧光诊断。技术队伍赤峰市医院病理科成立于本世纪七十年代，目前全科共有工作人员24人，主任医师一名，副主任医师4名，主治医师5名。其中有博士1名，硕士8名。医生先后经天津医科大学病理系、医学科学院肿瘤医院、广州中山大学肿瘤防治中心、北京协和医院、意大利安科纳联合大学医院和美国加州大学戴维斯医疗中心等地深造学习。李世君主任和科室骨干成员在国家、自治区和赤峰地区等多个学会团体内担任职务。率先在赤峰地区开展了免疫组化技术和分子病理检测，率先在全区开展了循环肿瘤细胞检测（CTC）、全基因检测和基因测序，并率先在全区成立了精准医学诊断中心。是内蒙古病理质量控制中心赤峰及周边地区区域病理质控分中心。在中华医学会病理专科分会组织的首届全国"华夏杯"冷冻切片比赛中荣获优秀组织奖。免疫组化连续七年通过全国免疫组化质控（CCP-IHCQC）认证。2016年肺癌基因检测EGFR通过欧盟EMQN质量认证。2018年结直肠癌基因检测K-ras、B-raf、N-ras通过欧盟EMQN质量认证，同年10月HER-2、ROS-1和ALK基因融合状态荧光原位杂交检测通过国家卫健委病理质控中心能力验证。