呼和浩特市第一医院病理科建立于1958年，现有工作人员12名，诊断医师6名，（其中主任医师1名、主治医师2名，住院医师3名），。技术人员及辅助人员6名（副主任技师1名，技师2名）。我院病理科经过多年的发展，已成为呼和浩特市医疗单位病理诊断技术水平最高的科室，年检手术及活检标本量10000余例，细胞学20000余例，免疫组化5000余例，分子病原学诊断10000余例，术中冰冻200余例。业务范围已从当初的单纯的常规病理诊断，发展到能够进行免疫病理、分子病理、细胞病理等辅助手段综合运用的诊断科室，为疾病诊断、患者用药指导方面发挥了重要作用。科室2015年与上海复旦临床病理诊断中心合作（位于上海市），成立云病理疑难会诊平台，实现了远程病理会诊，会诊诊断水平居全国前列。2018年与新途病理诊断中心合作（位于呼和浩特市），该中心诊断医师为美国病理诊断专家，诊断水平一流。通过与两家病理诊断中心的远程及实地合作，使得科室可以更全面、准确的解决疑难病理会诊及病理技术方面等问题。