1958年，附属医院成立随即组建了团支部，同年改为团总支。当时全院共有团员170名下设内科、外科、妇科、儿科、医技、行政后勤等六个团支部1966年，"文革"期间医院团组织的活动停止，团总支由新成立的政治处兼管。1971年恢复组织生活。1978年，团总支更名为团委，下设8个团支部，团员183名。1984年，团支部增至12个，全院有团员180名，健全了组织生活制度，恢复加强了"三会一课"制度。1992年，召开了共青团内蒙古医学院附属医院第一次代表大会。此后，又分别于1996、2002、2007年召开了第二、三、四次团代会。医院团委在院党委和上级团委的领导下，坚持"爱国、成才、奉献、敬业"的工作主题，紧紧围绕医院的中心工作，创造性地开展工作，广大团员青年在医院的发展建设中发挥了生力军的作用。院团委根据不同时期的工作重点，有针对性地开展了形式多样的有中国特色的社会主义、爱国主义和集体主义教育活动，提高了广大团员青年的思想政治素质，为各项工作的顺利完成奠定了良好的基础。作为党的助手和后备军，团委定期开展团员民主评议和"评优创先"、"推优入党"工作。一大批优秀的青年团员光荣的加入了党组织，为党组织输入了新鲜血液。积极开展"青年文明号"创建活动。1996年8月，为了响应团中央号召，在全区卫生系统率先开展争创"青年文明号"和争当"岗位能手"活动。制定了"号"、"手"活动的步骤、方案、监督和检查等项措施，并组织开展了"一号助一户"活动。通过上门进行医疗服务以及捐款捐物，解决子女上学困难等，对特困户进行了帮扶，受到了社会的一致称赞。1997年，我院荣获了国家级"青年文明号"称号。此后，院团委又不断加强了青年文明号的内涵建设，并顺利通过了每两年一次的复审。院团委还定期组织团员青年深入农村、牧区、社区开展社会实践活动。在解决当地群众看病难的同时，增强了广大团员青年的社会责任感，收到了良好的效果。2002年，我院被自治区团委评为"社会实践先迸单位"。2006年，被自治区团委授予"首批赴蒙古国志愿者项目‘优秀组织单位’"。发挥青年的特长，组织开展了卡拉OK大奖赛、文艺晚会、书画摄影比赛、辩论赛、主题演讲赛等形式多样、丰富多彩的文体活动，丰富了职工的业余文化生活，为医院的文化建设和精神文明建设发挥了积极的作用。