内蒙古民族大学附属医院国家药物临床试验机构是国家食品药品监督管理总局、国家卫生和计划生育委员会审批的国家级药物临床试验平台。2005年和2013年认定了蒙医血液、蒙医心血管、蒙医脑血管、蒙医风湿、蒙医内分泌、蒙医骨伤、蒙医外科、蒙医肿瘤科、蒙医妇科、蒙医消化科、蒙医呼吸科、蒙医疼痛科、蒙医肛肠科等13个临床专业试验资格认定，并通过复核审查。机构办公室专职技术人员7人，操作流程规范，标准操作规程完善，具有系统的质量控制体系，临床试验各项实验室检测均在医院医学检验中心、医学影像中心、功能检查可完成，数据均可在医院LIS系统系统中溯源。完成Ⅰ期、II期、III期新药临床试验共计150余项。完成《蒙医药治疗银屑病临床疗效评价研究》、《蒙医药治疗脑梗塞恢复期临床疗效评价研究》、《蒙医药治疗慢性原发性血小板减少性紫癜特色疗法的临床评价研究》、《含制草乌制剂‘嘎日迪-5’临床给药的规定剂量范围的安全性考察试验"和"含制水银制剂‘孟根乌苏—18’临床给药的规定剂量范围的安全性考察试验》等蒙药临床耐受、药效与安全性再评价、规范化、标准化研究项目12项。成为自治区蒙药生产企业形成蒙药开发"产、学、研联盟"构建了重要环节。