呼吸科成立于2004年，于2019年7月更名为"呼吸与危重症医学科"，集医疗、教学、科研为一体的临床诊疗中心，开放两个病区100张床位，医技护人员48人，医师18名，其中高级职称5名，中级职称8名，住院医师5名（硕士2名）。科室特色呼吸与危重症医学科为医院重点建设科室，新疆医科大学公共卫生学院实习基地、新疆维吾尔自治区住院医师规范化培训基地、新疆维吾尔自治区公共卫生医师规范化培训基地。设置6个亚专业组，分别：肺间质病组，慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、感染组，呼吸介入组，危重症专业组，肺结节（肺癌）组，呼吸功能实验室（肺功能检查）组，设置6个专科门诊、呼吸内镜室、呼吸功能检查室、呼吸介入诊疗室，并对全院个临床科室特别是胸外科、普外科和骨科手术患者的术前肺功能的评估及手术风险评估保驾护航。同时，承担全疆各地州、县100余家医院疑难危重呼吸道疾病的远程会诊工作。